Powermarker软件使用方法

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1. 将原始数据转置,即修改数据格式(修改成如下格式:) DNA ~ ~ 引物名称 引物名称 引物名称 ~~~~~ (写品种名称) 举例:设有7个品种,5个引物,则书写格式如下(注:因为水稻是二倍体,所以每个引物写两遍---两遍的数据一样,如下) DNA RM259 RM259 RM1 RM1 RM580 RM580 RM297 RM297 RM406 RM406 东农7180 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 松粳9号 1 1 1 1 2 2 2 2 2 2 龙稻4号 2 2 2 2 1 1 3 3 1 1 吉粳88号 2 2 1 1 3 3 1 1 1 1 松172 1 1 1 1 3 3 1 1 1 1 普引06-5 3 3 1 1 4 4 4 4 2 2 垦鉴稻8号 1 1 1 1 5 5 1 1 1 1 2. 把Excel文件转换成 .txt文件(方法:复制→粘贴到txt里)

3. 打开Powermarker软件→运行Dataset(用鼠标点Dataset)→设置一些参数(如下:)并

且点Browse(选择格式修改完的我们要分析的txt文件),按Next选项进入下一个 选择如下参数: ⊙From text file

√Tab √Comma √Space

4. 在对话框左边的下拉条框内 先点DNA 然后再点 下拉条框下的Categorical , 在右边的 Level-1 column()下选择DNA,按Next选项进入下一个

DNA √

5. 在Data Type中选择 第3个选项,如下, 然后按Next选项进入下一个对话框,再点

Finish

⊙This dataset is genotype data and gametic phase is unknown

6. 在最上面中选择 Analysis→sumary→sumary statistics→在出来的对话框中选择我们要分

析的文件(在对话框的左边的中间,用鼠标点文件名)→按左下的 Submit。(操作结束) 7. 如想保存文件 ,则双击左上的Marker。 AlleleNo(等位基因数)

GeneDiversity(基因多样性---与PIC类似) PIC(多态性信息含量指数)

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