质粒载体构建

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附录A 表达载体的构建

1、大肠杆菌质粒DNA的提取(SDS碱裂解法)

该方法参照分子克隆指南的方法修订而成。 细胞的制备

(1) 将2ml含相应抗生素的LB培养基加入到容量为15ml并通气良好(不盖紧)的试管中,然后接入单菌落,于37℃剧烈振摇下培养过夜。

(2) 将1.5ml培养物倒入微量离心管中,用微量离心机于4℃以最大转速离心30s,将剩余的培养物贮存于4℃。

(3) 吸去培养液,使细菌沉淀尽可能干燥。 细胞的裂解

(4) 将细菌沉淀重悬于100μl用冰预冷的碱裂解液I中,剧烈振荡。 (5) 加200μl新配制的碱裂解液Ⅱ于每管细菌悬液中,盖紧管口,快速颠倒离心管5次,以混合内容物。应确保离心管的整个内表面均与碱裂解液Ⅱ接触。不要振荡,将离心管放置于冰上。

(6) 加150μl用冰预冷的碱裂解液Ⅲ,盖紧管口,反复颠倒数次,使溶液Ⅲ在粘稠的细菌裂解物中分散均匀,之后将管置于冰上3-5min。

(7) 用微量离心机于4℃以最大转速离心5min,将上清转移到另一离心管中。 (8) 加等量体积的氯仿:异戊醇(24:1),振荡混合有机相和水相,然后用微量离心机于4℃以最大转速离心5min,将上清转移到另一离心管中。 质粒DNA的回收

(9) 用2倍体积的乙醇于室温沉淀核酸。振荡混合,于室温放置2min。 (10) 用微量离心机于4℃以最大转速离心5min,收集沉淀的核酸。 (11) 小心吸去上清液,将离心管倒置于一张纸巾上,以使所有液体流出,再将附于管壁的液滴除去。

(12) 加1ml 70%乙醇于沉淀中并将盖紧的离心管颠倒数次,用微量离心机于4℃以最大转速离心2min,回收DNA。

(13) 小心吸去上清液,将离心管倒置于一张纸巾上,以使所有液体流出,再将附于管壁的液滴除去。

(14) 将开口的离心管置于室温使酒精挥发,直至离心管内没有可见的液体存在(5-10min)。

(15) 用50μl含有去DNA酶的RNA酶A(20μg/ml)的TE重新溶解核酸,温和几秒钟振荡,贮存于-20℃。

2、质粒DNA的酶切、回收与连接

质粒DNA的酶切

(1) 提取的质粒DNA用相应的酶进行酶切。 酶切体系为:

单酶切

ddH2O 质粒DNA 10×buffer 限制性内切酶Ⅰ

8μl 10μl 2μl

ddH2O 质粒DNA 10×buffer 限制性内切酶Ⅱ 限制性内切酶Ⅲ

双酶切

8μl 10μl 2μl 0.4μl 0.4μl

0.4μl

混匀,简单离心后,37℃水浴反应2-4h。 酶切产物进行1%琼脂糖凝胶电泳检测。

(2) 单酶切需要用小牛肠碱性磷酸酶(CIAP)去除质粒DNA两端的磷酸基,以防止自身环化。

①酶切产物纯化。取酶切产物加1/10体积3mol/LNaAc和2倍体积预冷无水乙醇,冰上放置5min,12000rpm离心5min,回收沉淀,用预冷的70%酒精洗涤沉淀2次,倒置风干,用25μl TE Buffer溶解。

②CIAP的去磷酸反应。

DNA ddH2O 10×AP buffer CIAP

25μl 19μl 5μl 1μl

混匀,简单离心后,37℃反应1h。

③去磷酸产物纯化。取去磷酸产物加1/10体积3mol/LNaAc和2倍体积预冷无水乙醇,冰上放置5min,12000rpm离心5min,弃上清,倒置风干,用20μl 以下的TE Buffer溶解。 质粒DNA的回收

采用TaKaRa Agarose Gel DNA Purification Kit Ver.2.0进行凝胶回收。 (1) 对酶切产物进行1%琼脂糖凝胶电泳。在紫外灯下切出含有目的 DNA 的琼脂糖凝胶,用纸巾吸尽凝胶表面的液体。此时应注意尽量切除不含目的

DNA 部分的凝胶,尽量减小凝胶体积,提高DNA回收率。

(2) 切碎胶块。称量胶块重量,以重量:体积1:3(1mg=3μl)向胶块中加入胶块融化液DR-I Buffer。

(3) 均匀混合后,75℃加热融化胶块,此时应间断振荡混合,使胶块充分融化(约6-10分钟)。胶块一定要充分融化,否则严重影响DNA回收率。

(4) 向上述胶块融化液中加入DR-I Buffer量的1/2体积量的 DR-II Buffer,均匀混合。

(5) 将试剂盒中的Spin Column安置于Collection Tube上。

(6) 将上述操作(4)的溶液转移至Spin Column中,12000 rpm离心1 min,将滤液再加入Spin Column中离心一次,可以提高DNA的回收率。

(7) 将500μl的Rinse A加入Spin Column中,12000 rpm离心30 s,弃滤液。 (8) 将700μl的Rinse B加入Spin Column中,12000 rpm离心30 s,弃滤液。请确认Rinse B中已经加入了指定体积的100%乙醇。

(9) 重复操作步骤(8)。

(10) 将Spin Column安置于Collection Tube上,12000 rpm离心1 min。 (11) 将Spin Column安置于新的1.5 ml的离心管上,在Spin Column膜的中央处加入25μl的预热至60 ℃灭菌蒸馏水或 Elution Buffer,室温静置1 min。

(12) 12000 rpm离心1 min洗脱DNA,4 ℃保存备用。 质粒DNA的连接

将酶切回收的目的片段DNA和载体DNA用T4 DNA ligase进行连接,连接产物可直接转化大肠杆菌。

连接体系:

PEG4000 Vector DNA

10×ligase buffer T4 DNA ligase

1μl 0.5μl 5.5μl 2μl 1μl

先将Vector和DNA混合好,置于45℃水浴5min,马上置于冰上冷却,再加入其他成分,混匀,简单离心后,置16℃过夜。

3、大肠杆菌感受态细胞的制备(CaC12法)

全过程都要在冰上进行,且动作尽量要轻

(1) 从37℃培养16-20h的平板中挑取单菌落,转到5ml LB液体培养基中,

37℃,250rpm,培养过夜(约16h)。

(2) 按1%接种量接种到含有50ml LB液体培养基的500ml三角瓶中,37℃,250rpm,培养2-2.5h(定时检测OD600值,使OD600≈0.4)。

(3) 将菌液转移到一个无菌的、一次性使用的、用冰预冷的50ml离心管中,冰上放置10min,使培养物冷却至0℃。

(4) 于4℃,4000rpm离心10min,以回收细胞。

(5) 倒出培养液,将管倒置1min以使最后的痕量培养液流尽。

(6) 每50ml初始培养液用30ml冰预冷的0.1mol/L CaC12溶液重悬细胞沉淀。 (7) 于4℃,4000rpm离心10min,以回收细胞。

(8) 倒出培养液,将管倒置1min以使最后的痕量培养液流尽。

(9) 每50ml初始培养液用2ml冰预冷的0.1mol/L CaC12溶液重悬细胞沉淀,置于冰上4-10min,分装成200μl /1.5mL离心管中,于-70℃保存备用。

4、大肠杆菌的转化

(1) 取DNA连接物10μl,冰浴下加入到200μl大肠杆菌感受态细胞中,混匀,冰上放置30min;其间可轻摇管2-3次,防止菌体沉于管底。

(2) 将管放入预加温至42℃的循环水浴中,热激90s,不要摇动管。 (3) 快速将管转移到冰浴中,室细胞冷却1-2min。

(4) 每管加入到800μlSOC液体培养基中,37℃,200rpm温育40min-1h,以使大肠杆菌复苏,并表达质粒编码的抗生素抗性标记基因。

(5) 将适当体积(每个90mm平板达200μl)已转化的感受态细胞转移到含相应抗生素的SOB平板上,室温放置直至液体被吸收。

(6) 倒置平皿,于37℃培养12-16h。

5、重组子的鉴定

(1) 重组子的PCR鉴定:

①从平板上挑取白色单菌落,于装有1ml LB(含有相应抗生素)的1.5ml离心管内37℃培养过夜;

②取1μl菌液作为模板,对单菌落进行PCR鉴定,初步筛选出含目的片段的阳性菌落。

(2) 重组质粒的酶切鉴定:

将待测阳性菌落进行扩培,用SDS碱裂解法进行质粒DNA的提取,通过酶切分析对阳性重组子进行最终确认。

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