浙江大学医学院神经生物学实验室常用实验流程

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浙江大学医学院神经生物学实验室常用实验流程

1、琼脂糖电泳分离的DNA片段的回收 2、感受态细胞的制备 3、DNA的转化

4、小量质粒DNA提取和纯化 5、中量质粒DNA提取和纯化 6、聚合酶链式反应操作(PCR) 7、点突变形成 8、诱导表达及检测

9、SDS-PAGE和WESTERN BLOT 10、免疫共沉淀(HEK293T细胞) 11、免疫组化

12、细胞培养注意事项及常用溶液配置方法 13、细胞传代培养(消化法) 14、细胞的复苏 15、细胞冻存

16、海马神经元原代培养 17、免疫细胞化学

18、HEK 293T细胞转染 (10cm培养皿) 19、磷酸钙介导的神经元转染 20 Co--IP

21 MBP-PICKI表达纯化 22 RNA提取步骤 补充 磷酸钙转染 溶液配置

目 录

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1、琼脂糖电泳分离的DNA片段的回收

(详见Axygen公司DNA凝胶回收试剂盒产品说明。) 准备工作:调整到75°C水浴;在Buffer W2 中按标签上指定的体积加入无水乙醇。 记录每个1.5 ml Eppendorf(自备)的重量:为A重量(g)

分别将两小块胶(cDNA和载体)切下、切碎,放入1.5 ml Eppendorf,再次称重: 为B重量(g)

加入3×(B-A)ml的DE-A液,75°C×7min (使胶溶解完全) 加入1.5×(B-A)ml的DE-B液,混匀 (翻转混匀即可)

短速离心,使管壁和管盖上的溶液沈降到管底。

将DNA制备管放入2ml离心管(试剂盒提供)中。将以上混合液,加入DNA制备管,5000rpm离心1分钟

弃去滤液,将制备管放回到2ml离心管中,加入0.5ml W1溶液,5000rpm离心1分钟

弃去滤液,将制备管放回到2ml离心管中,加入0.7ml W2溶液,5000rpm离心1分钟 重复一次

将DNA制备管放回到2ml离心管中,12000rpm×1min,弃此2ml离心管

将DNA制备管放入无菌1.5ml 离心管(试剂盒提供)中,在DNA制备膜正中加25ul Eluent 静置1min

12000rpm×1min,收集DNA, 约25ul

2、感受态细胞的制备

实验准备:无抗性LB平板,1ml装、6ml装LB小管,100ml装LB锥形瓶,0.1mol/L的氯化钙,0.1mol/L

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的氯化钙加15%的甘油,50ml离心管。

实验步骤:因为整个过程中没有使用抗生素所以要特别注意无菌操作! 1.铺无抗性的LB平板。为避免意外,一般铺两块无抗性LB平板。

2.用1ml的枪戳几下菌库中的菌种,使得枪头上带有少量冰渣。这个过程要迅速,避免菌种发生冻融或污染。

3.将冰渣溶于1ml 37℃预热的LB中,充分混匀后,用枪吸取20ul转移至另一只装有1ml 37℃预热的LB的 EP中,混匀后取100ul涂板。37℃孵育14个小时。观察菌落数量和相关理化特征,用封口膜密封4℃冻存。

4.用牙签挑取单克隆至4~6ml无抗性LB小管中260rpm 12小时(活化)。这一步可以多挑几个克隆,以防其长不出来和有明显的污染。

5.取500ul菌液到100ml无抗生素的LB锥形瓶中300rpm 3小时。注意观察,控制菌的浓度在OD600时不要超过0.6。

6.把100ml菌液分装在两只50ml离心管(已灭过菌)中,冰浴10分钟。 7.5000rpm、4℃离心10分钟,弃上清。离心机需要4℃预冷。

8.用0.1mol/l的氯化钙10ml重悬浮。徒手将50ml离心管反复戳于冰上从而使细菌重悬浮。因为感受态细胞比较脆弱易破损,故重悬浮时不宜使用震荡仪。悬浮要充分! 9. 5000rpm、4℃离心10分钟,弃上清。

10.用0.1mol/L的氯化钙加15%的甘油2ml重悬浮。注意事项同8。 11.以200ul每管分装,分装后冻存于-80℃。注明制备日期和菌名。

注意事项:因为培养基无抗性,故无菌操作是整个感受态制备的关键。制备过程最好带上口罩,所有的用具需要充分灭菌。为了保证感受态的质量所有的步骤都需在冰上进行。 方法二:

做感受态细胞步骤:(材料要灭菌,并无菌冰上操作)

1, 从-70度拿出库存的大肠杆菌,用划线涂布法接种于不加任何抗生素的基本培养皿上(取稀释之意 ,或拿1ml

枪头在冰上没融化的菌中浸一下,放入1ml LB 中,再吸20ul入另一个1ml LB中,再吸另一个的100ul铺板)37度倒置培养12-16小时(DH-5a)

2, 挑一克隆于6ml不加任何抗生素的LB中,250r/min 37度, 振12小时。培养皿挑好后放入4度冰箱

3, 吸500ul 菌液于不加任何抗生素的LB 100ml 锥形瓶中,300r/min 37度, 振3小时,然后把锥形瓶放在写有字

的纸上,透过菌液可看清纸上的字,并测OD约为0.6(吸1ml),如果每到这个值就再大约摇半小时再测OD约为0.6就可以。

3

4, 将两个50ml试管冰上预冷,再将培养液放入(倒入)其中,冰上10分钟。 5, 7号转头4度 5000 rpm 10分钟

6, 弃干上清,扣干凉1分钟,再各加10ml 0.1mol/L CaCl2 (每50ml 菌液10ml CaCl2) (CaCl2不含甘油,从4度

拿出在冰上预冷,用无菌移液管吸)

7, 冰上轻旋摩擦开菌斑(要轻,并且所有内容物保持在冰中)之后再放在冰上30分钟。 8, 4度 4100 rpm 10分钟 9, 弃上清,扣干凉1分钟

10, 两管各加含甘油CaCl2 2ml (每50ml菌液加2ml甘油CaCl2) (其中15体积甘油Glycerol 85体积CaCl2, 从4

度拿出在冰上预冷, 用枪吸), 再用同样的方法冰上轻旋摩擦开菌斑 11, 在冰上分装100ul或200ml 的多个管子 12, -80度冷藏

3、DNA的转化

准备工作:制冰,42°C水浴,37°C摇床,37°C预热LB

自制的感受态细胞

加20ul 连接产物

冰上30 '

O

42 C水浴90秒(热休克,时间要求精确)

冰上2'

加800ul LB(-) (预先37 OC预热)

摇床,37 OC 225转/分 45分钟

O

400ul菌液涂平板,37C温箱中培养过夜

同时做两个对照:

对照组1: 以同体积的无菌双蒸水代替DNA溶液,其它操作与上面相同。此组正常情况下在含抗生素的LB平板上应没有菌落出现。

对照组2: 以同体积的无菌双蒸水代替DNA溶液,但涂板时只取5μl 菌液涂布于不含抗生素的

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