原核表达步骤

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实验方法与步骤

1 表达质粒的构建及测序分析 1.1 cofilin-1的片段的准备 1.1.1 引物设计

根据在GenBank上查找人源cofilin-1的基因序列,用Primer Premier 5.0软件进行上下游引物的设计,并送往上海生物工程技术服务有限公司合成的PCR引物。引物如下:

引物名称 F-cofilin-1 R-cofilin-1

序列

5′-AAGTCGACATATGGCCTCCGGTGTG-3′ 5′-TCTCTCGAGGGCTCACAAAGGCTTG-3′

将以上引物用灭菌的三蒸水稀释成10μmol/L,分装于Eppendorf管中,-20℃冰箱中保存备用。 1.1.2 cofilin-1片段PCR 1 反应体系:

KOD polymerase(3’-5’核酸外切酶活性)

KOD polymerase buffer MgSO4

DMSO(“万能溶剂”) dNTPMixture PrimerF(底物) PrimerR

Template(模板) ddH2O Total

2 PCR反应条件:

2.5μl

5μl 2.5μl 2.5μl 5μl 1.5μl 1.5μl 5μl 25μl 50μl

①94℃预变性 ②94℃退火 ③65℃延伸 ④68℃ ⑤go to② ⑥68℃ ⑦4℃

3 琼脂糖凝胶电泳对PCR产物进行检测

(1)配置浓度为1%的凝胶。称取琼脂糖0.3g,加入30ml 1×TAE电泳缓冲液(Tris-乙酸电泳缓冲液)中,用微波炉加热2min,待凝胶稍冷却,加入2μl EB(溴化乙锭,荧光染色剂)混匀后倾入凝胶铸槽中,插入梳子,并用玻璃棒驱除气泡,待凝胶完全凝结后拔除梳子。

(2)把凝胶置于1×TAE电泳缓冲液的电泳槽中,加样孔置于负极一侧,然后依次在加样孔中加入50μl Marker、50μl样品+10μl loading buffer(上样缓冲液,可以显示两条带,前面的蓝色的条带是溴酚蓝,代表的片段大小是 300bp,后面的有点绿色的条带是二甲苯青,代表的片段大小在4000bp左右),盖上电泳盖,以100V电压进行电泳。

(3)当Marker条带充分分开后即可停止电泳,将凝胶移至保鲜膜上,置于凝胶自动成像仪中分析。

4 割胶回收PCR反应体系的扩增产物,用Omega Bio-Tek公司的Gel Extrection Kit进行回收:

(1)将PCR扩增产物经1%的琼脂糖凝胶电泳,在紫外灯下迅速切取含有目的条带的琼脂糖凝胶,放入灭菌的EP管中。DNA在紫外灯下曝光时间不超过30s。 (2)称量凝胶块重量,以1g=1ml进行计算,加入适量体积的binding buffer,55-65℃加热至凝胶完全融化(约7~10min),每隔2~3min震荡一次。 (3)将Hibind DNA柱子套在2ml的收集管。将上述步骤(2)的溶液转移至Hibind DNA柱子中,10000×g离心1min,弃滤液。

(4)将柱子装回收集管中,加入300μl binding buffer, 10000×g离心1min,

3min 30s 40s 40s 30个循环 5min forever

弃滤液。

(5)将柱子装回收集管中,加入700μl SPW wash buffer,10000×g离心1min,弃滤液。

(6)重复步骤(5)一次。

(7)弃滤液,将柱子装回收集管中,13000×g离心1min,以甩干柱子。 (8)将柱子安置于灭菌的1.5ml的离心管上,在柱子中央处加入30~50μl的65℃预热的灭菌ddH2O,室温放置2min。13000×g离心2min,洗脱DNA。

1.2 表达载体pET-28a质粒的抽提

接种含pET-28a的大肠杆菌DH5α,37℃培养过夜。质粒抽提采用Omega Bio-Tek公司的Plasmid Mini Kit I进行质粒小抽:

1 取-20℃冰箱中保存的含pET-28a质粒的DH5α菌种50μl接种于4ml的LB培养基(含卡那霉素100μg/ml)中,37℃,180rpm培养12h。划平板,活化菌种,置于37℃恒温箱中培养过夜,挑单菌落接种于4ml的LB培养基(含卡那霉素100μg/ml)中(培养基中加卡那霉素抑制杂菌和不含目的基因的菌),37℃,180rpm培养12h。

2 加入200μl GPS buffer(硅胶柱平衡缓冲液,减少柱子中硅胶模的憎水基团,有利于结合核酸)于柱子中,室温放置2min,10000×g离心2min,弃去掉收集管中的废液,柱子平衡完毕。

3 将菌液移至灭菌的EP管中,室温下,10000×g离心1min,彻底去除上清,收集沉淀菌体。

4 加入200μl Solution I/RNase A混合液,浮涡旋震荡使细菌充分悬浮。 5 往重悬液中加入200μl Solution Ⅱ,轻轻颠倒EP管4-6次,使细菌裂解,室温放置2min,至溶液变成澄清。

6 加入300μl Solution Ⅲ,温和颠倒数次,至溶液出现白色絮状沉淀。室温下,10000×g离心10min。

7 取出平衡后的柱子置于收集管上,将步骤6中的上清全部转移到柱子里。室温下,10000×g离心1min,弃滤液。

8 将柱子装回收集管中,加入500μl HiBind buffer。室温下,10000×g离心1min,弃滤液。

9 将柱子装回收集管中,加入700μl Wash Solution。室温下,10000×g离心1min。重复该步骤一次。 10 重复步骤9一次。

11 弃滤液,将柱子装回收集管中,13000×g离心1min,以甩干柱子。 12 将柱子安置于灭菌的1.5ml的离心管上,在柱子中央处加入30~50μl的65℃预热的灭菌ddH2O,室温放置2min。13000×g离心2mi。

跑1%的琼脂糖凝胶电泳检测质粒抽提纯度。-20℃冰箱中保存备用。

1.3 cofilin-1片段和表达载体的双酶切

用NdeI和XhoI分别酶切PCR产物cofilin-1 cDNA和表达载体pET-28a,37℃水浴反应4h,反应体系如下:

表达载体酶切体系: 表达载体 10×H Buffer(LMHKT代表缓冲液中盐浓度或成分不同) XhoI NdeI ddH2O Total

1μl 1μl 1μl 20μl

XhoI NdeI ddH2O Total

1μl 1μl 6μl 20μl

15μl 92μl

PCR产物酶切体系: cofilin-1片段 10×H Buffer

10μl 2μl

1.4 酶切产物的回收

酶切产物分别进行1%琼脂糖凝胶电泳后,胶回收酶切产物。步骤同PCR反应产物胶回收。

1.5 连接反应

将PCR产物cofilin-1 cDNA的酶切回收产物和表达载体pET-28a的酶切回收产物于16℃连接24h,反应体系如下:

cofilin-1 cDNA酶切回收产物 pET-28a酶切回收产物

18μl 6μl

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