DNAStar中文使用说明书

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? 滚动到窗口的最顶端。你将注意到,在histone基因的左和右有2酶

切位点:Acs I和Apo I。两个酶切位点对我们来说都是理想的。 现在我们将制作仅仅包括Apo I酶切位点的Manual Pick filter。 ? 从ENZYME MENU,选New Filter——然后Manual Pick。打开酶切位

点过泸器编辑器。

? 把Apo I从右边的窗口拖进左边的窗口。给过泸器取名。在这我们把

过泸器叫做“Apo I.”。

? 点击Apply——然后OK,就保存并应用

“Apo I.”过泸器了。

? 注意到现在线性的minimap仅仅由Apo I

酶切位点和histone特点构成。

使用过泸器一览表

现在我们已经应用了2个过泸器:一个叫做“Two-cuts-max”的频率过泸器和叫做“Apo I.”的手动过滤器,MapDraw会自动把两个过泸器的结果用“AND,”联合起来应用,这样,展示的结果需要满足两个标准:切割一或两次,用Apo I切割。我们手动过滤器包括频率过泸器的单一切点的内容,所以他自动的覆盖了频率过泸器的结果。下述过泸器一览表允许我们随意编辑、组合各个过泸器。

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? 从Map Document,单击

过泸器调色板工具(在窗左上的漏斗图标)打开过泸器一览表(如

下)。当前应用的所有过泸器都出现于窗口的左边。

? 为了除掉Apo I过滤器,点击选中它,从左窗口拖到右边的窗口,单

击应用即可。现在由于只有Two-cuts-max过泸器被应用,所以序列上的酶切位点数目立即增加了。

? 把Apo I过滤器拖回,放在And旁,单击Apply再次应用Apo I过滤器,

序列上的酶切位点数目又立即减少了。(如果把Apo I过滤器拖回,放在Or旁,单击Apply再次应用Apo I过滤器,序列上的酶切位点数目不会改变,因为Apo I过滤器是Two-cuts-max过泸器的一部分)。 ? 按上面的方法把两个过滤器都去除。

使用Must Cut Here / Don’t Cut Here调色板工具

Must Cut Here / Don’t Cut Here工具是另一种酶切位点过滤限制方法。我们将用这个方法再次重复上面的操作。 ? 从MAP MENU,选Site & Sequence。

? 向下滚动,直到你看在大的向右指的箭头,上写“histone”。 单击选中。点击Don’t Cut Here调色板工具(红色园圈起的剪刀样图标),去除所有切割选定区的酶切位点。(点击Must Cut Here工具——剪刀样图标——序列上将展示所有切割选定区的酶切位点。)

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