分子生物学实验指导(精)

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[作业]

1.步骤8的2支试管中溶液颜色的变化说明了什么?将得出的结论填写在《实验报

告册》上。

2.提取鸡血中的DNA时,为什么要除去血液中的上清液?

3. 步骤1和步骤3中都需要加入蒸馏水,两次加入的作用相同吗?为什么?

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实验四 质粒DNA的制备

[实验目的]

通过本实验,学习和掌握碱裂解法提取质粒。

[实验原理]

碱裂解法提取质粒是根据共价闭合环状质粒DNA与线性染色体DNA在拓扑学上的差异来分离它们。在pH值介于12.0~12.5这个狭窄的范围内,线性的DNA双螺旋结构解开而被变性,尽管在这样的条件下,共价闭环质粒DNA的氢键会被断裂,但两条互补链彼此相互盘绕,仍会紧密地结合在一起。当加入pH4.8的乙酸钾高盐缓冲液恢复PH至中性时,共价闭合环状质粒DNA的两条互补链仍保持在一起,因此复性迅速而准确,在而线性的染色体DNA的两条互补链彼此已完全分开,复性就不会那么迅速而准确,它们缠绕形成网状结构,通过离心,染色体DNA与不稳定的大分子RNA、蛋白质-SDS复合物等一起沉淀下来而被除去。

[实验仪器与设备]

1.恒温培养箱 2.恒温摇床

3.台式离心机(最大转速4000rpm) 4.冷冻高速离心机 5.高压灭菌锅 6.超净工作台 7.微量移液器 8.eppendorf tub、tip

[实验材料]

1.葡萄糖 2.三羟甲基氨基甲烷(Tris) 3.乙二胺四乙酸(EDTA) 4.氢氧化钠 5.十二烷基硫酸钠(SDS) 6.乙酸钾 7.冰乙酸 8.氯仿 9.乙醇 10.胰RNA酶 11.氨苄青霉素 12.蔗糖 13.溴酚蓝 14.酚 15.β巯基乙醇 16.盐酸 17.含pUC18质粒的大肠杆菌

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附:试剂的配制

1.溶液Ⅰ

50mmol/L 葡萄糖

5mmol/L 三羟甲基氨基甲烷(Tris) Tris·HCl (pH8.0) 10mmol/L 乙二胺四乙酸(EDTA)(pH8.0) 2.溶液Ⅱ

0.4 mol/L NaOH, 2%SDS, 用前等体积混合 3.溶液Ⅲ

5mmol/L 乙酸钾 60 mL 冰乙酸 11.5 mL 水 28.5 mL 4.TE缓冲液

10mmol/L Tris· HCl 1 mmol/L EDTA(pH8.0)

5.70%乙醇(放-20℃冰箱中,用后即放回) 6.胰RNA酶

将RNA酶溶于10mmol/L Tris·HCl(pH7.5)、15mmol/L NaCl中,配成10mg/mL的浓度,于100 ℃加热15min,缓慢冷却至室温,保存于-20 ℃。 7.终止液:40%蔗糖、0.25%溴蓝酚 8.酚

[实验步骤]

(一) 提取质粒

1.将2mL含相应抗生素的LB液体培养基加入到试管中,接入含质粒的大肠杆菌,37℃振荡培养过夜。

2.取1.5mL培养物倒入微量离心管中,4000rpm,离心2min。 3.吸去培养液,使细胞沉淀尽可能干燥。

4.将细菌沉淀悬浮于100μL溶液Ⅰ中,充分混匀,室温放置10 min。 5.加200μL溶液Ⅱ(新鲜配制),混匀内容物,将离心管放冰上5 min。 6.加入150μL溶液Ⅲ(冰上预冷),盖紧管口,颠倒数次使混匀。 7.1200rpm,离心15 min,将上清转至另一离心管中。

8.向上清中加入等体积酚:氯仿(去蛋白),反复混匀,12000rpm,离心5min,将上清转移到另一离心管中.

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9.向上清加入2倍体积乙醇,混匀后,室温放置5-10min。12000rpm离心5min。倒去上清液,把离心管倒扣在吸水纸上,吸干液体。

10.用1mL70%乙醇洗涤质粒DNA沉淀,振荡并离心,倒去上清液,真空抽干或空气中干燥。

11.加50μL TE缓冲液,其中含有20μg/mL的胰RNA酶,使DNA完全溶解,-20℃保存。

(二)琼脂糖凝胶电泳检测DNA 方法参见实验二

[作业]

1. 碱裂解法提取质粒DNA 的原理是什么?

2. 用凝胶成像系统拍照质粒DNA电泳图,并分析电泳所得条带

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