生物化学考试辅导资料1 联系客服

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多相邻的片段,在连接酶的催化下,连接成为一条长链。连接作用是在连接酶催化下进行的。连接酶的作用是催化各相邻的DNA片段以3′→5′磷酸二酯键相连接。连接反应中的能量来自ATP(或NAD+)。 4终止

终止区,在此区中包括有5个ter序列,其核心序列为GTGTGTGT,它们可以和Tus蛋白结合,阻止了解链酶发挥作用,促使复制的终止。

DNA复制完毕后,又可在拓扑酶作用下,在DNA分子中引入超螺旋结构,进行进一步的装配。 下面小结:参与大肠杆菌DNA复制的蛋白,见表。 蛋白质 作用 DnaB蛋白(拓扑异构酶Ⅰ) 开始解链 引物酶(DnaG) 合成RNA引物 rep蛋白(解链酶) 解开双链 SSB(单链结合蛋白) 稳定单股链区 DNA旋转酶(拓扑异构酶Ⅱ) 引入负超螺旋 DNA polⅢ全酶 合成DNA DNA polⅠ 去除引物,补充空隙 DNA连接酶 连接DNA片段 DnaA蛋白 连接DNA片段辨认起始点 (三)真核生物DNA的复制特点 (1)真核生物中复制进行的速度约为50个核苷酸/秒,仅为原核生物的1/10,但真核生物染色体上DNA复制起始点有多个,因此可以从几个起始点上同时进行复制。

(2)真核生物DNA复制过程中的引物及冈崎片段的长度均小于原核生物。真核长约100-200个核苷酸,原核长约1000-2000个。

(3)其真生物DNA的复制有DNA聚合酶及多种蛋白质因子参与,DNA聚合酶也有多种类型。其中DNA Polα及DNA Polδ在细胞核内DNA的复制中起主要作用。DNAPolδ催化前导链及随从链的合成,PCNA参与其作用。

DNA Polα与引物酶共同催化引发链的合成。DNA Polδ有3′→5′外切酶活性,因此有校正的功能。 DNA Pol γ是线粒体中的复制酶。 二、反转录作用及端粒酶 1.反转录作用

反转录作用即是以RNA为模板,由dNTP聚合生成DNA的作用。催化此反应酶为反转录酶或逆转录酶。

反转录酶具有多种酶活性,其催化的反应是:①RNA指导的DNA合成反应;②RNA的水解反应;③DNA指导的DNA合成反应。

反转录酶催化的DNA合成反应也是5′→3′合成方向。在DNA合成开始进行时,需要有引物。 反转录酶没有3′→5′外切酶活性,因此它没有校正功能,反转录作用的错误率相对较高。 2端粒酶

真核生物线形染色体的末端具有一种特殊的结构,称为端区或端粒。端区结构中有核苷酸重复序列,一般在一条链上为TxGy,互补链为CyAx,x与y大约在1-4范围内,人的端粒区含有TTAGGG重复序列。 端区具有保护DNA双链末端,使其免遭降解及彼此融合的功能。端区的平均长度随着细胞分裂次数的增多及年龄的增长而变短,可导致核生物染色体稳定性下降,并导致衰老。其分子机制在于,线形DNA分子不能从末端核苷酸外合成RNA引物,如此染色体将逐代缩短。但是在生殖细胞、胚胎细胞和肿瘤细胞中,由于有端粒酶,所以并不出现这种情况。

端粒酶是一种由RNA和蛋白质组成的酶,RNA和蛋白质都是酶活性必不可少的组分。可看作是一种反转录酶。此酶组成中的RNA可作为模板,催化合成端区的DNA片段。端粒酶催化合成端区,在保证染色体复制的完整性上有重要意义。 三、DNA的修复合式

需要进行修复的DNA损伤,见表: DNA损伤 原因 碱基丢失 酸及热去嘌呤 碱基变化 电离辐射,烷化剂 错误的碱基 自发脱氨基作用:C→U,A→次黄嘌呤 缺失/插入 嵌入剂 环丁基二聚体 紫外辐射 DNA链断裂 电离、化学物质诱导(博莱霉素) DNA链交联 化学物质诱导(丝裂霉素) (一)DNA复制过程中的校正修复 DNA复制过程中会发生错误的,这可以由DNA聚合酶来修正错误。在大肠杆菌DNA复制过程中,如果有错误核苷酸掺入,DNA聚合暂时停止催化聚合作用,而是由DNA PolⅠ或 PolⅢ的 3′→5′外切

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酶活性切除错误的碱基,然后继续再催化正确的聚合作用。真核生物DNA Polδ也具有此种校对作用。所以DNA聚合酶的校对作用是DNA复制中的修复形式,可使错配率下降至10-6。 其他能够保证DNA复制准确性的机制在于:

(1)以亲代DNA为模板,按碱基互补配对方式进行DNA复制。 (2)细胞内DNA错配修复机制,可使错配减少至10-9以下。 (二)DNA的损伤修复

修复是指针对已发生了的缺陷而施行的补救机制,DNA的修复机制的有数种方式,有光修复、切除修复、重组修复、SOS修复等,其中以切除修复最为重要。 1光修复

通过光修复酶催化而完成的,仅需300-600nm波长照射即可活化,普遍存在于各种生物,人体细胞中也有发现。通过此酶作用,可使环丁基二聚体分解为原来的非聚合状态,DNA完全恢复正常。 2切除修复

切除修复是指对DNA损伤部位先行切除,继而进行正确的合成,补充被切除的片段。大肠杆菌有两种切除修复方式。

(1)由糖基化酶起始作用的切除修复。

糖基化酶识别损伤或错误的碱基而水解糖苷键,造成DNA骨架中因丢失碱基而形成一个洞,称为AP部位。特异的AP内切酶识别AP位点,切断其与DNA骨架的连接;继而在外切酶作用下,切下AP位点的核苷酸。随后,在DNA聚合酶Ⅰ的作用下,以未受损伤的DNA链为模板正确合成,补充缺口,最后在连接酶作用下连成一条完整的DNA链。

(2)UvrABC修复。原核生物与紫外线损伤修复有关的一些基因,称为UvrA、UvrB、UvrC。其产物,UvrA,UvrB是辨认及结合DNA损伤部位的蛋白质,UvrC有切除损伤部位相邻12个核苷的酸的作用,可能还需要有解螺旋酶的协助,才能把损伤部位除去。然后由DNA聚合酶Ⅰ补充空隙,连接酶连接,完成修复。

3重组修复

当DNA分子的损伤面较大,还来不及修复完善就进行复制时,损伤部位因无模板指引,复制出来的新子链会出现缺口,这时,就靠重组蛋白recA的核酸酶活性将别一股健康的母链与缺口部分进行交换,以填补缺口。 4SOS修复

指DNA损伤时,应急而诱导产生的修复作用,称为SOS修复。在正常情况下,修复蛋白的合成是处于低水平状态的,这是由于它们的mRNA合成受到阻遏蛋白LexA的抑制。细胞中的recA蛋白也参与了SOS修复。当DNA受到严重损伤时,recA以其蛋白酶的功能水解破坏LexA,从而诱导了十几种SOS基因的活化,促进了此十几种修复蛋白的合成。 一、转录作用

(一)转录作用及其特点

转录作用是DNA指导的RNA合成作用。反应是以DNA为模板,在RNA聚合酶催化下,以四种三磷酸核苷(NTP)即ATP、GTP、CTP及UTP为原料,各种核苷酸之间的3′、5′磷酸二酯键相连进行的聚合反应。合成反应的方向为5′→3′。反应体系中还有Mg2+、Mn2+等参与,反应中不需要引物参与。碱基互补原则为A-U、G-C,在RNA中U替代T与A配对。

DNA分子多为双股链的分子,在转录作用进行时,DNA双链中只有一条链作为模板,指导合成与其互补的RNA。此DNA链称为模板键,另一条链称为编码链。编码链的序列与转录本RNA的序列基本相同,只是编码链上的T在相应转录本上为U,由于转录本RNA编码基因表达的蛋白质产物,DNA的这条链也由此命名为编码链。编码链又称为有义链;模板链又称为反义链。

在多基因的双链DNA分子中,每个基因的模板不是全在同一条链上,也就是在双链DNA分子中的一条链,对于某基因是有义链,但对另一个基因则可能是反义链。

转录作用开始时,RNA聚合酶结合于基因的特定部位,在此附近DNA双键打开约17个碱基对,形成一转录泡,进行核苷酸的聚合反应。随着RNA聚合酶沿着DNA模板链向5′末端的方向移动,核苷酸的聚合反应继续进行。 ( 二)RNA聚合酶

催化转录作用的酶是RNA聚合酶。 1原核生物RNA聚合酶

大肠杆菌RNA聚合酶的结构是由五个亚基组成,为二条α链,一条β链,一条β′链和一条ζ因子链,α2ββ′四个亚基组成核心酶,加上ζ因子后成为全酶α2ββ′ζ。ζ因子与核心酶的结合不紧密,容易脱落。RNA聚合酶β亚基有促进聚合反应中磷酸二酯键生成的作用。β′亚基是酶与模板结合时的主要部分。ζ因子没有催化活性,它可以识别DNA模板上转录的起始部位。

RNA聚合酶具有多种功能,①它可从DNA分子中识别转录的起始部位。②促进与酶结合的DNA双链分子打开17个碱基对。③催化适当的NTP以3′、5′磷酸二酯键相连接,如此连续进行聚合反应完成一条RNA转录本的合成。④识别DNA分子中转录终止信号,促使聚合反应的停止。RNA聚合酶还参与了转录水平的调控。

原核生物RNA聚合酶的几个特点:①聚合速度比DNA复制的聚合反应速率要慢;②缺乏3′→5′外

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切酶活性,无校对功能,RNA合成的错误率比DNA复制高很多;③原核生物RNA聚合酶的活性可以被利福霉素及利福平所抑制,这是由于它们可以和RNA聚合酶的β亚基相结合,而影响到酶的作用。 2.真核生物的RNA聚合酶

真核生物中已发现有四种RNA聚合酶,分别称RNA聚合酶Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Mt。

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