发布时间 : 星期日 文章使用Multiwfn图形化研究弱相互作用更新完毕开始阅读
际上理应显示成淡蓝色，但由于色彩刻度上下限的设定有一定随意性，导致同一个色彩刻度范围未必对每个体系都很合适。如果不同体系不用同一个上下限，在横向比较作用强弱的时候又会缺乏基准，而且需要每次手动调整，略微麻烦，一般来说还是按照原文，色彩刻度统一使用[-0.04,0.02]范围为好。但遇到颜色与期望的差异较大时，最好还是看看散点图上相应spike的位置来确认。色彩刻度的随意性是这种分析方法的一个弊端，不同色彩刻度下得到的此体系的等值面如下图所示，差异是很明显的。另外屏幕对比度、可视化程序中分子与光源的相对朝向等诸多问题都可能影响色彩，给定量比较带来些麻烦。
[图11]
下图的四个体系分别是：1. 环氧乙烷与氟化氯通过卤键形成的复合物 2.二环[2,2,1]庚烷 3.gauche构象的苯乙胺 4.直立构象的甲基环己烷。这些留给读者自行分析，在原文的补充材料中也有很多例子，值得一看。
[图12]
4 实例
这里以苯酚二聚体为例介绍如何绘制sign(λ_2)ρ函数填色的RDG等值面图。
phenoldimer.wfn //文件名 100 //功能100
1 //绘制“函数1 vs. 函数2”散点图并生成相应格点文件 15,13 //sign(λ_2)ρ是第15号函数，RDG是第13号函数 -10 //设定延展距离 0 //延展距离为0 bohr
2 //用中等质量格点
现在开始计算，由于体系稍大，所以计算稍微耗时。由于计算sign(λ_2)需要计算电子密度的Hessian矩阵，会比计算RDG函数要费时不少。经过约5~10分钟（视CPU速度而定）计算完毕。当选取的函数1和函数2分别为sign(λ_2)ρ和RDG函数时，散点图的x,y坐标轴范围会分别自动调到[-0.05,0.05]和[0.0,2.0]，所以直接用功能-1就能看到合适的散点图了，如下图上方所示。之后选择功能3将函数1和函数2的高斯类型格点文件输出到当前目录下func1.cub和func2.cub。
[图13]
虽然能显示高斯类型格点文件的等值面的程序很多，但支持将一个函数数值用不同颜色填到另外一个函数的等值面上的