生物化学(第三版,课后答案 联系客服

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13370),进一步实验表明,该毒素蛋白与FDNB反应并酸水解后,释放出游离的DNP-Gly和DNP-Tyr。关于此蛋白的结构,你能做出什么结论?[该毒素蛋白由两条不同的多肽链通过链间二硫键交联而成,每条多肽链的相对分子质量各在13000左右。]

13.一种蛋白质是由相同亚基组成的四聚体。(a)对该分子说出两各种可能的对称性。稳定缔合的是哪种类型的相互作用(同种或异种)?(b)假设四聚体,如血红蛋白,是由两个相同的单位(每个单位含α和β两种链)组成的。问它的最高对称性是什么?[(a)C4和D2,C4是通过异种相互作用缔合在一起,D2是通过同种相互作用缔合在一起,(b)C2因为每个αβ二聚体是一个不对称的原聚体]

14.证明一个多阶段装配过程比一个单阶段装配过程更容易控制蛋白质的质量。考虑一个多聚体酶复合物的合成,此复合物含6个相同的二聚体,每个二聚体由一个多肽A和一个B组成,多肽A和B的长度分别为300个和700个氨基酸残基。假设从氨基酸合成多肽链,多肽链组成二聚体,再从二聚体聚集成多聚体

-8

酶,在这一建造过程中每次操作的错误频率为10,假设氨基酸序列没有错误的话,多肽的折叠总是正确的,并假设在每一装配阶段剔除有缺陷的亚结构效率为100%,试比较在下列情况下有缺陷复合物的频率:(1)该复合物以一条6000个氨基酸连续的多肽链一步合成,链内含有6个多肽A和6个多肽B。(2)该复合物分3个阶段形成:第一阶段,多肽A和B的合成;第二阶段,AB二聚体的形成;第三阶段,6个AB二聚体装配成复合物。

-8-5

[(1)有缺陷复合物的平均频率是6000×10=6×10]

[(2)由于有缺陷的二聚体可被剔除,因此有缺陷复合物的平均率只是最后阶段的操作次数(5次操作装

-8

配6个亚基)乘以错误频率,即:5×10。因此它比一步合成所产生的缺陷频率约低1000倍。]

第六章 蛋白质结构与功能的关系

1.蛋白质A和B各有一个配体X的结合部位,前者的解离常数Kd为10mol/L,后者Kd为10mol/L。(a)哪个蛋白质对配体X的亲和力更高?(b)将这两个蛋白质的Kd转换为结合常数Ka。[(a)蛋白质B;(b)

6-19-1

蛋白质A的Ka=10(mol/L),蛋白质B的Ka=10(mol/L)

2.下列变化对肌红蛋白和血红蛋白的O2亲和力有什么影响?(a)血浆的pH从7.4降到7.2;(b)肺中CO2分压从45torr(屏息)降到15torr(正常);(c)BPG水平从4.5mmol/L(海平面)增至7.5mmol(高空)。[对肌红蛋白:(a)无;(b)无;(c)无。对血红蛋白:(a)降低;(b)增加;(c)降低]

3.在37℃,pH7.4,CO2分压40 torr和BPG正常胜利水平(4.5mmol/L血)条件下,人全血的氧结合测定给出下列数据:

p(O2) 10.6 19.5 27.4 37.5 50.4 77.3 92.3

%饱和度(=100×Y)

10 30 50 70 85 96 98

-6

-9

(a) 根据这些数据,绘制氧结合曲线;估算在(1)100torr p(O2)(肺中)和(2)30 torr p(O2)(静

脉血中)下血的氧百分饱和度。

(b) 肺中[100 torr p(O2)]结合的氧有百分之多少输送给组织[30 torr p(O2)]? (c) 如果在毛细血管中pH降到7.0,利用图6-17数据重新估算(b)部分。 [(a)(1)98%,(2)58%;(b)约40%;(c)约50%] 解:(a)图略,从图中克知分别为98%和58%;

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(b)98%-58%=40%,故约40%;

(c)当pH降到7.0时,据图6-17可知:96%-46%=50%。

n

4.如果已知P50和n,可利用方程(6-15)Y/(1-Y)=[ p(O2)/ P50]计算Y(血红蛋白氧分数饱和度)。设P50=26 torr,n=2.8,计算肺(这里p(O2)=100 torr)中的Y和毛细血管(这里p(O2)=40 torr)中的Y。在这些条件下输氧效率(Y肺-Y毛细血管=ΔY)是多少?除n=1.0外,重复上面计算。比较n=2.8和n=1.0时的ΔY值。并说出协同氧结合对血红蛋白输氧效率的影响。[n=2.8时,Y肺=0.98,Y毛细血管=0.77,所以,ΔY=0.21,n=1.0时,Y肺=0.79,Y毛细血管=0.61,所以,ΔY=0.18,两ΔY之差0.21-0.18=0.03,差值似乎不大,但在代谢活跃的组织中p(O2)<40 torr,因此潜在输氧效率不小,参见图6-15]

2.8

解:Y肺/(1-Y肺)=[100/26] Y肺=0.98

2.8

Y毛/(1-Y毛)=[40/26] Y毛=0.77 ΔY=0.98-0.77=0.21

当n=1.0时,同理,Y肺=0.79 Y毛=0.61 ΔY=0.18

5.如果不采取措施,贮存相当时间的血,2.3-BPG的含量会下降。如果这样的血用于输血可能会产生什么后果?[贮存过时的红血球经酵解途径代谢BPG。BPG浓度下降,Hb对O2的亲和力增加,致使不能给组织供氧。接受这种BPG浓度低的输血,病人可能被窒息。]

6.HbA能抑制HbS形成细长纤维和红细胞在脱氧后的镰刀状化。为什么HbA具有这一效应?[去氧HbA含有一个互补部位,因而它能加到去氧HbS纤维上。这样的纤维不能继续延长,因为末端的去氧HbA分子缺少“粘性”区。]

7.一个单克隆抗体与G-肌动蛋白结合但不与F-肌动蛋白结合,这对于抗体识别抗原表位能告诉你什么?[该表位可能是当G-肌动蛋白聚合成F-肌动蛋白时被埋藏的那部分结构。]

-7

8.假设一个Fab-半抗原复合体的解离常数在25℃和pH7时为5×10mol/L。(a)结合的标准自由能(25℃和pH7时)是多少?(b)此Fab的亲和力结合常数是多少?(c)从该复合体中释放半抗原的速度常数为

-10

120S。结合的速度常数是多少?此说明在结合半抗原时抗体中的结构变化是大还是小?[(a)ΔGˊ

6-18-1-1

=35.9kJ/mol;(b)Ka=2×10molL;(c)结合速度常数k=2×10molSL,此值接近于小分子与蛋白质相

89-1-1

遇(结合)的扩散控制限制(10至10molSL)]

0

解:(a)ΔGˊ=-RTlnKa=-8.31×298×ln2000000=-35.9kJ/mol

-76-1

(b)Ka=1/Keq=1/5×10=2×10molL

9.抗原与抗体的结合方式与血红蛋白的氧结合相似。假设抗原是一价,抗体是n价,即抗体分子有n个结合部位,且各结合部位的结合常数Ka值是相同的,则可证明当游离抗原浓度为[L]时,结合到抗体上的抗原浓度[Lp]与抗体的总浓度[Pr]之比值:N =[Lp]/[Pr]=(nKa [L])/(1+Ka [L]),N实际上表示被一个抗体分子结合的抗原分子平均数。

(a)证明上面的方程可重排为N /[L]=Kan-KaN 此方程式称Scatchard方程,方程表明,N /[L]对N作图将是一条直线。

(b)根据Scatchard方程,利用下列数据作图求出抗体-抗原反应的n和Ka值。

[L] mol/L 1.43×10

-5

2.57×10

-5

6.00×10

-4

1.68×10

-4

3.70×10

-5

N 0.5 0.77 1.20 1.68 1.85

[(a)第一个方程两边各乘(1+Ka [L]),然后两边各除以[L],并重排第2个方程;(b)根据第二方程,

-4

N /[L]对N作图的斜率是-Ka,N /[L]=0时的截距给出n。利用数据作图得Ka =2.2×10 mol/L,n=2.1。因为结合部位数目只可能是整数,所以n=2]

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10.一个典型的松弛肌节中细丝长约2μm,粗丝长约为1.5μm。 (a) 估算在松弛和收缩时粗丝和细丝的重叠情况。

(b) 一次循环中肌球蛋白沿细丝滑行“一步”移动约7.5nm,问一次收缩中每个肌动蛋白纤维需要进行

多少个步?

[(a)约0.75nm,(b)约67步] 解:(a)根据P281图6-35A所示,

当松弛时重叠总长度为:(1+1)-(3-1.5)=0.5μm 0.5/2=0.25μm 当收缩时重叠总长度为:(1+1)-(2-1.5)=1.5μm 1.5/2=0.75μm

3

(b)(3-2)÷2×10÷7.5≈67步

第七章 蛋白质的分离、纯化和表征

1.测得一种血红素蛋白质含0.426%铁,计算最低相对分子质量。一种纯酶按重量计算含亮氨酸1.65%和异亮氨酸2.48%,问其最低相对分子质量是多少?[13110;15870] 解:(1)蛋白质Mr=55.8÷0.426%=13100 (2)亮氨酸和异亮氨酸的分子质量都是131Da,根据两种氨基酸的含量来看,异亮氨酸:亮氨酸=2.48%:1.65%=3:2,所以在此蛋白质中的亮氨酸至少有两个,异亮氨酸至少有三个,那么:蛋白质Mr =2×(131-18)/1.65%=13697Da

2.超速离心机的转速为58000r/min时,(1)计算角速度ω,以rad/s表示;(2)计算距旋转中心6.2cm处的离心加速度a;(3)此离心加速度相当于重力加速度“g”的多少倍?

82

[(1)ω=6070.7rad/s (2)a=2.284×10cm/s;(3)a=233061g] 解:(1)ω=58000×2π/60=6070.7rad/s

282

(2)a=(6070.7)×6.2=2.284×10cm/s

6

(3)2.285×10/9.8=233061

2

3.一种蛋白质的偏微比容为0.707cm/g,当温度校正为20℃,溶剂校正为水时扩散系数(D20.W)为13.1×-723

10cm/s.沉降系数(S20.W)为2.05S。20℃时水的密度为0.998g/ cm,根据斯维德贝格公式计算该蛋白质的相对分子质量。[13000]

-7

解:Mr=(RTS)/[D(1-υρ)]=8.314×(273+20)×2.05/[13.1×10(1-0.707×0.998)]=13000

4.一个层析柱中固定相体积(Vs)为流动相体积(Vm)的1/5。假设某化合物的分配系数,(a)Kd=1;(b)Kd=50。计算该化合物的有效分配系数(Keff),也称容量因子(capacity)。[(a)Keff=0.2;(b)Keff=10]

5.指出从分子排阻层析柱上洗脱下列蛋白质时的顺序。分离蛋白质的范围是5000到400000;肌红蛋白、过氧化氢酶、细胞色素C、肌球蛋白、胰凝乳蛋白酶原和血清清蛋白(它们的Mr见表7-4)。[肌球蛋白、过氧化氢酶、血清清蛋白、胰凝乳蛋白酶原、肌红蛋白、细胞色素C]

6.由第5题所述的,从分子排阻层析柱上洗脱细胞色素C、β-乳球蛋白、未知蛋白和血清红蛋白时,其洗脱体积分别为118、58、37和24ml,问未知蛋白的Mr是多少?假定所有蛋白质都是球形的,并且都处于柱的分级分离范围。[52000]

7.在下面指出的pH下,下述蛋白质在电场中相哪个方向移动,即向正极、负极还是不动?(根据表7-2的数据判断。)(1)血清蛋白,pH5.0;(2)β-乳球蛋白,pH5.0和7.0;(3)胰凝乳蛋白酶原,pH5.0、9.1和11。[(1)正极;(2)负极、正极;(3)负极、不动、正极] 解:(1)卵清蛋白pI=4.6,pH=5.0>4.6 带负电,向正极移动;

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(2)β-乳球蛋白pI=5.2,pH=5.0<5.2 带正电,向负极移动; pH=7.0>5.2 带负电,向正极移动; (3)胰凝乳蛋白酶原pI=9.1,pH=5.0<9.1 带正电,向负极移动;

pH=9.1=pI 净电荷为零,不移动; pH=11>9.1 带负电,向正极移动;

8.(1)当Ala、Ser、Phe、Leu、Arg、Asp和His的混合物在pH3.9进行纸电泳时,哪些氨基酸移向正极?哪些氨基酸移向负极?(2)纸电泳时,带有相同电荷的氨基酸常有少许分开,例如Gly可与Leu分开,试说明为什么?(3)设Ala、Val、Glu、Lys和Thr的混合物pH为6.0,试指出纸电泳后氨基酸的分离情况。

PI值:Ala:6.02 Ser:5.68 Phe:5.48 Leu:5.98 Arg:10.76 Asp:2.97 His:7.59 [(1)Ala、Ser、Phe和Leu以及Arg和His向负极,Asp移向正极;(2)电泳时,具有相同电荷的较大分子比较小分子移动得慢,因为电荷/质量之比较小,因而引起每单位质量迁移的驱动力也较小。(3)Glu移向正极,Lys移向负极,Val、Ala和Thr则留在原点。]

9.凝胶过滤层析和凝胶电泳中的分子筛效应有什么不同?为什么?

答:凝胶过滤层析中每一个凝胶珠相当于一个分子筛,故小分子所经过的路径长,落在大分子后面;而凝胶电泳中整块胶板相当于一个分子筛,故大分子受到的阻力大而迁移慢,落在小分子后面。

10.配制一系列牛血清清蛋白(BSA)稀释液,每一种溶液取0.1ml进行Bradford法测定。对适当的空白测定595nm波长处的光吸收(A595)。结果如下表所示:

BSA浓度(mg·L)

1.5

1.0 0.8 0.6 0.4 0.2

-1

A595 1.4 0.97 0.79 0.59 0.37 0.17

BSA浓度对A595作图得标准曲线。E.coli的蛋白质提取液样品(0.1ml)测得的A595为0.84。根据标准曲线算出E.coli提取液中的蛋白质浓度。[0.85mg/ml]

解:标准曲线略。由标准曲线可知,当A595为0.84时,BSA浓度为0.85mg/ml。

第八章 酶通论

1.酶作为生物催化剂有哪些特点?

答:酶是细胞所产生的,受多种因素调节控制的具有催化能力的生物催化剂,与一般非生物催化剂相比较有以下几个特点:1、酶易失活;2、具有很高的催化效率;3、具有高度专一性;4、酶活性受到调节和控制。

2.何谓酶的专一性?酶的专一性有哪些?如何解释酶作用的专一性?研究酶的专一性有何意义?

答:酶的专一性是指酶对催化的反应和反映物有严格的选择性。酶的专一性分为两种类型:1、结构专一性,包括绝对专一性、相对专一性(族专一性或基团专一性、键专一性);2、立体异构专一性,包括旋光异构专一性、几何异构专一性。

通过对酶结构与功能的研究,确信酶与底物作用的专一性是由于酶与底物分子的结构互补,诱导契合,通过分子的相互识别而产生的。

对酶的专一性研究具有重要的生物学意义。它有利于阐明生物体内有序的代谢过程,酶的作用机制等。

3.酶的活性受那些因素调节,试说明之。