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第一节 基因组学
一、基因组学包含结构基因组学、功能基因组学和比较基因组学 二、结构基因组学的主要任务是基因组作图和大规模测序 〔一〕遗传作图和物理作图是绘制人类基因组草图的重要策略 1、遗传作图就是绘制连锁图
2、物理作图就是描绘杂交图、限制性酶切图及克隆系图 〔二〕通过BAC克隆系、鸟枪法等完成大规模DNA测序 1、BAC克隆系的构建是大规模DNA测序的基础 2、鸟枪法是大规模DNA测序的重要方法
3、高通测序技术大大加快了基因组DNA测序进度 〔三〕生物信息学是测定基因组结构和功能的重要手段 三、功能基因组学系统探讨基因的活动规律
〔一〕通过全基因组扫描鉴定DNA序列中的基因 〔二〕通过BLAST等程序搜索同源基因 〔三〕通过实验设计验证基因功能
〔四〕通过转录组和蛋白质组描述基因表达模式
第二节 转录组学
一、转录组学研究全部mRNA的表达及功能
〔一〕微阵列是大规模基因组表达谱研究的主要技术 〔二〕SAGE在转录物水平研究细胞或组织基因表达模式
〔三〕MPSS是以基因测序为基础的基因表达谱自动化和高通量分析新技术 二、RNA组学研究非编码RNA的集合
第三节 蛋白质组学
一、蛋白质组学研究细胞内所有蛋白质的组成及其活动规律 〔一〕蛋白质鉴定是蛋白质组学的基本任务
〔二〕翻译后修饰的鉴定有助于蛋白质功能的阐明 〔三〕蛋白质功能确定是蛋白质组学的根本目的 二、二维电泳和质谱是蛋白质组学研究的常规技术 〔一〕二维电泳是分离蛋白质组的有效方法 〔二〕质谱技术是蛋白质组鉴定的重要工具 1、用肽质量指纹图谱鉴定蛋白质 2、用串联质谱鉴定蛋白质
〔三〕蛋白质相互作用研究是认识蛋白质功能的重要内容
第四节 代谢组学
一、代谢组学的任务是分析生物/细胞代谢产物的全貌 二、核磁共振、色谱及质谱是代谢组学的主要分析工具 三、代谢组学数据依赖模式识别技术进行分析
第五节 其他组学
一、糖组学研究生命体聚糖多样性及其生物学功能 〔一〕糖组学分为结构糖组学与功能糖组学两个分支
〔二〕色谱分离/质谱鉴定和糖微阵列技术是糖组学研究的主要技术 1、色谱分离与质谱鉴定技术 2、糖微阵列技术 3、生物信息学
〔三〕糖组学与肿瘤的关系密切
二、脂组学揭示生命体脂质多样性及其代谢调控 〔一〕脂质组学是代谢组学的一个分支 1、样品分离 2、脂质鉴定 3、数据库检索
〔二〕脂组学研究的三大步骤――分离、鉴定和数据库检索 〔三〕脂组学促进脂质生物标志物的发现和疾病诊断
第六节 组学在医学上的应用
〔一〕定位克隆技术是发现和鉴定疾病基因的重要手段 〔二〕SNPs是疾病易感性的重要遗传学基础
二、药物基因组学揭示遗传变异对药物效能和毒性的影响 〔一〕药物基因组学预测药物反应性并指导个体化用药 〔二〕基因多态性是药物基因组学的基础和重要研究内容 〔三〕鉴定基因序列的变异是药物基因组学的主要研究策略 三、蛋白质组学发现和鉴别药物新靶点
〔一〕疾病相关蛋白质组学的研究是发现和研究药物新靶点的有效途径 〔二〕耐药病原体的蛋白质组学将为新一代抗生素的发现提供新的契机 〔三〕信号转导分子和途径是药物设计的合理靶点 四、代谢组学是开展预测医学和个体化医学的重要手段 〔一〕代谢组学丰富了预测医学的内涵 〔二〕代谢组学促进了个体化医学的发展